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日本女性科学者の会は「女性科学者の友好を深め、各研究分野の知識の交換を図り、女性科学者の地位向上をめざすとともに、世界の平和に貢献すること」を目的として1958年4月に「日本婦人科学者」の名称で設立されました。この設立にあたり、当時女性国際民主連合副会長の平塚らいてう女史、ノーベル賞受賞者の湯川秀樹博士をはじめとする世界平和アピール七人委員会から多大なご支援を頂きました。設立から半世紀にわたり、第一線で活躍する会員および非会員による講演会、女性科学者・研究者の地位問題に関するシンポジウム開催など幅広く活動してきました。1996年6月に名称を「日本女性科学者の会」と改め、1999年には第11回国際女性技術者科学者会議を主催しました。
特に最近は、2002年10月から男女共同参画学協会連絡会に加盟し、科学技術の分野において、女性と男性が共に個性と能力を発揮できる環境づくり・ネットワークづくりと社会貢献を目指して活動しています。2004年には日本学術会議19期第4部登録学術団体となり、理学振興研究連絡委員会委員および科学教育研究連絡委員会オブザーバーとして活動しました。この理学振興研究連絡委員会で起草された「科学･技術を文化としてみる気風を醸成するために」は、第19期日本学術会議第4部対外報告書として2005年6月に10項目の提言を付して刊行されました。現在の日本学術会議20期には、本会から5名（2部:生命科学2名、3部:理学･工学3名；内２名は本会の奨励賞受賞者）の会員が日本学術会議会員として参加、活躍中です。
さらに、2003年から2005年には、国立女性教育会館の女性研究者ネットワーク支援のための懇談会に本会の佐々木前会長が参加し、自然科学と人文社会科学という分野を越えて女性研究者が能力を十分に発揮し、活躍できるようにするために、研究支援に関する情報収集、意見交換、研究成果の社会的活用、異分野の女性研究者ネットワーク化促進に資するための方策について検討しました。「女子高校生夏の学校」(国立女性教育会館、男女共同参画学協会連絡会など主催)にも毎年、共催参加しています。
会員は、理学・工学（数学、物理学、化学、生物学、地学等）、医学、薬学、農学、家政学等を専攻する大学、研究機関などに所属する研究者および企業の研究者･技術者で、幅広い科学･技術分野をカバーし、男性研究者･技術者も活動に参加しています。
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